การเลี้ยงสัตว์ ไม่ว่าจะเป็นโค กระบือ แพะ แกะ สุกร หรือสัตว์ปีก การจัดการที่ไม่ดีอาจนำมาสู่การติดปรสิตในทางเดินอาหาร ซึ่งสัตว์ที่ติดเชื้อสามารถแพร่กระจายเชื้อสู่ สิ่งแวดล้อมได้โดยการขับไข่ออกมาพร้อมกับมูล ไข่เหล่านี้จะเจริญเติบโตในสิ่งแวดล้อม จนกลายเป็นระยะติดต่อที่พร้อมเข้าสู่ร่างกายสัตว์ ทำให้เกิดการติดเชื้อในฟาร์ม        การเลี้ยงแบบแออัดและการจัดการมูลสัตว์ไม่ดีทำให้สัตว์มีโอกาสสัมผัสกับระยะติดต่อของปรสิตมาก การติดปรสิตในทางเดินอาหารในสัตว์ที่ภูมิคุ้มกันต่ำอาจก่อให้เกิดความเสียหายต่อสุขภาพสัตว์อย่างรุนแรง ส่วนในสัตว์ที่มีภูมิคุ้มกันดีการติดปรสิตอาจไม่ก่อให้เกิดอาการผิดปกติให้เห็น แต่ส่งผลกระทบต่อผลผลิตได้ วิธีตรวจวินิจฉัยการติดปรสิตในทางเดินอาหารเบื้องต้น มักใช้วิธีการตรวจอย่างง่าย (Direct fecal smear or fresh fecal smear) ซึ่งวิธีนี้ใช้ตัวอย่างมูลสัตว์เพียงเล็กน้อยส่องตรวจด้วยกล้องจุลทรรศน์ การตรวจจึงมีโอกาสไม่พบไข่พยาธิหรือโอโอซีสต์ของโปรโตซัวที่อยู่ในตัวอย่างได้